31. NGHIÊN CỨU ĐỘT BIẾN GEN Pvcrt LIÊN QUAN ĐẾN KHÁNG CHLOROQUINE Ở PLASMODIUM VIVAX TẠI MƯỜNG TÈ, LAI CHÂU BẰNG REAL-TIME PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ TOÀN BỘ HỆ GEN
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Nghiên cứu nhằm đánh giá mức độ biểu hiện và đột biến gen Pvcrt liên quan đến kháng Chloroquine ở Plasmodium vivax tại huyện Mường Tè, tỉnh Lai Châu, Việt Nam.
Phương pháp: Nghiên cứu mô tả cắt ngang trên 48 mẫu máu dương tính P. vivax, thu thập từ tháng 10/2022-3/2024. Biểu hiện Pvcrt được định lượng bằng qPCR, đột biến được xác định qua giải trình tự toàn bộ hệ gen Illumina. Bổ sung tổng quan tài liệu quốc tế từ 2008-2023 về gen Pvcrt và kháng Chloroquine.
Kết quả: 14,6% mẫu có biểu hiện Pvcrt tăng cao, 4,2% mang đột biến C350T, 12,5% có chèn codon 10 (K10). Mối liên hệ giữa C350T và tăng biểu hiện Pvcrt có ý nghĩa thống kê (p < 0,05). Tổng quan tài liệu khẳng định vai trò của Pvcrt trong kháng thuốc tại nhiều khu vực Đông Nam Á và Nam Á.
Kết luận: Pvcrt là chỉ dấu tiềm năng trong giám sát kháng Chloroquine ở P. vivax. Khuyến nghị phân tích biểu hiện và đột biến Pvcrt vào chương trình giám sát sốt rét tại Việt Nam.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Plasmodium vivax, Pvcrt, kháng Chloroquine, đột biến gen, biểu hiện gen
Tài liệu tham khảo
[2] Baird J.K, Hoffman S.L, White N.J, Resistance to therapies for infection by Plasmodium vivax, Clin Microbiol Rev. 2009, 22 (3): 508-534.
[3] Melo G.C, Monteiro W.M, Siqueira A.M et al, Expression levels of pvcrt-o and pvmdr-1 are associated with chloroquine resistance and severe Plasmodium vivax malaria in patients of the Brazilian Amazon, PloS One, 2014, 9 (8): e105922.
[4] Barnadas C, Ratsimbasoa A, Tichit M et al, P. vivax resistance to Chloroquine in Madagascar: clinical efficacy and polymorphisms in pvcrt-o and pvmdr1 genes, Antimicrob Agents Chemother, 2008, 52 (12): 4233-4240.
[5] Sharma A, Rawal C, Jindal A et al, Expression pattern of pvcrt-o and polymorphisms in P. vivax isolates from India, Acta Tropica, 2022, 230: 106370.
[6] Amato R, Pearson R.D, Almagro-Garcia J et al, Origins of the current outbreak of multidrug-resistant malaria in Southeast Asia, Nat Microbiol, 2018, 3: 1195-1205.
[7] Cingolani P, Platts A, Wang L.L et al, A program for annotating and predicting the effects of SNPs, SnpEff, Fly, 2012, 6 (2): 80-92.
[8] Miotto O, Amato R, Ashley E.A et al, Genetic architecture of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum, Nat Genet, 2015, 47 (3): 226-234.
[9] McKenna A, Hanna M, Banks E et al, The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data, Genome Res, 2010, 20 (9): 1297-1303.
[10] Li H, Durbin R, Lam T.W et al, Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform, Bioinformatics, 2009, 25 (14): 1754-1760.
[11] Alexander D.H, Novembre J, Lange K, Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals, Genome Res, 2009, 19 (9): 1655-1664.
[13] Price R.N, Douglas N.M, Anstey N.M, New developments in Plasmodium vivax malaria: severe disease and the rise of Chloroquine resistance, Curr Opin Infect Dis, 2009, 22 (5): 430-435.