THIẾT LẬP VÀ ĐÁNH GIÁ TÍNH PHÙ HỢP QUY TRÌNH NHẬN DẠNG VIRUS ROTA SỬ DỤNG BỘ SINH PHẨM QIAGEN ONE-STEP RT-PCR

Dang Thi Ngan Ha, Nguyen Dang Hien, Tran Thi Bich hanh, Nguyen Thuy Huong

Main Article Content

Abstract

Trung tâm Nghiên cứu, Sản xuất Vắc-xin và Sinh phẩm y tế (POLYVAC) hiện nay đang sử dụng phương pháp RT-PCR để thực hiện thử nghiệm nhận dạng vắc-xin Rota bán thành phẩm và thành phẩm chủng G1P[8]. Với phương pháp này, sản phẩm sau khi tách chiết sẽ được chạy PCR 2 lần, chu trình RT-PCR cần khoảng 8 giờ để nhận dạng typ G1 và tương tự cần 8 giờ để nhận dạng typ P[8]. Tổng thời gian thực hiện thử nghiệm từ khi tách chiết đến chạy điện di đọc kết quả mất khoảng 3 ngày.


Bằng việc sử dụng bộ kit QIAGEN OneStep RT-PCR, chúng tôi đã rút ngắn được tổng thời gian thử nghiệm xuống còn 1,5 ngày do chỉ cần chạy PCR 1 lần duy nhất vừa phiên mã ngược, vừa nhân bản sản phẩm phiên mã trong cùng 1 chu trình phản ứng, tổng thời gian mất khoảng 3 giờ cho chu trình PCR để nhận dạng typ G1 và typ P[8]. Kết quả nghiên cứu đã thiết lập được quy trình thử nghiệm nhận dạng virus Rota sử dụng bộ kit QIAGEN OneStep RT-PCR (100) phù hợp với yêu cầu của thử nghiệm và có kết quả tương đồng với thử nghiệm nhận dạng hiện đang áp dụng tại POLYVAC.

Article Details

References

[1] Đặng Đức Anh. Virus Rota: dịch tễ, miễn dịch và vắc-xin. Nhà xuất bản Y học, Hà Nội, 2010.
[2] Nguyễn Văn Mẫn, Lê Thị Luân, Nguyễn Thúy Hường, Nguyễn Thị Quỳ. Giám sát dịch tễ học căn bệnh tiêu chảy do virus Rota tại Việt Nam từ 8/1998 đến tháng 12/2002. Tạp chí Y học thực hành, 2003, (469): 33-35.
[3] Nguyễn Thúy Hường, Nguyễn Phương Thảo, Trần Thị Bích Hạnh, Nguyễn Đăng Hiền. Nghiên cứu tính ổn định của vắc-xin Rotavin công thức cải tiến sản xuất tại Việt Nam. Tạp chí Y học dự phòng, 2020, 30 (7): 18-25.
[4] Phạm Thị Phương Thảo. Nghiên cứu, đánh giá các chủng virus Rota lưu hành tại Việt Nam từ năm 1998 đến nay. Luận văn thạc sĩ y học, Trường Đại học Khoa học tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội, 2010.
[5] Quick-Start Protocol QIAGEN OneStep RT-PCR Kit.
[6] World Health Organization. Guidelines to assure the quality, safety and efficacy of live attenuated rotavirus vaccines (oral). WHO Technical Report Series, 2007, No. 941, annex3, 2007.
[7] World Health Organization. Thermostability of Vaccines. Global programme for vaccines and immunization. GPV /98.07, 1998.
[8] World Health Organization. Rotavirus vaccines, 2013, 88 (5): 49-64.
[9] World Health Organization. Manual of Rotavirus detection and characterization, methods, 2009, 47-99.